Ngày 12 tháng 5 năm 1964, Bộ Nội vụ ban hành Quyết định số 150-NV.[3] Theo đó:

• Đổi tên xã Liên Hiệp thành xã Lãng Ngâm
• Đổi tên xã Cao Thành thành xã Thiều Quan
• Đổi tên xã Đồng Minh thành xã Trung Hòa
• Đổi tên xã Hồng Thái thành xã Vân Tùng
• Đổi tên xã Long Bằng thành xã Thuần Mang
• Đổi tên xã Nỗ Lực thành xã Hương Nê
• Đổi tên xã Công Bằng thành xã Bằng Đức
• Đổi tên xã Thành Tâm thành xã Thượng Ân
• Đổi tên xã Lê Lợi thành xã Cốc Đán
• Đổi tên xã Chí Kiên thành xã Đức Vân.

Sau năm 1975, huyện Ngân Sơn thuộc tỉnh Bắc Thái, gồm 13 xã: Bằng Đức, Bằng Khẩu, Cốc Đán, Đức Vân, Hương Nê, Lãng Ngâm, Ngân Sơn, Thiều Quan, Thuần Mang, Thượng Ân, Thượng Quan, Trung Hòa, Vân Tùng.

Ngày 23 tháng 10 năm 1978, hợp nhất xã Ngân Sơn và xã Vân Tùng thành một xã lấy tên là xã Vân Tùng.[4]

Ngày 29 tháng 12 năm 1978, chuyển huyện Ngân Sơn về tỉnh Cao Bằng vừa được tái lập.

Ngày 16 tháng 1 năm 1979, hợp nhất xã Bằng Khẩu và xã Bằng Đức thuộc huyện Ngân Sơn thành một xã lấy tên là xã Bằng Vân.[5]

Ngày 8 tháng 10 năm 1980, thành lập thị trấn Nà Phặc trên cơ sở toàn bộ diện tích và dân số của xã Thiều Quan cùng các bản: Cốc Pái, Nà Tỏ, Nà Kèng, Nà Làm, Nà Duồng, Nà Ma, Khuổi Tinh, Thâm Sang của xã Trung Hòa. Tuy nhiên, Nà Phặc không phải là thị trấn huyện lỵ huyện Ngân Sơn, trung tâm hành chính huyện đặt tại xã Vân Tùng.

Ngày 6 tháng 11 năm 1996, chuyển huyện Ngân Sơn về tỉnh Bắc Kạn vừa được tái lập.

Ngày 1 tháng 2 năm 2020, sáp nhập xã Hương Nê và xã Lãng Ngâm thành xã Hiệp Lực.[6]

Huyện Ngân Sơn có 1 thị trấn và 9 xã như hiện nay.